魔女小队面临史上最强异形军，唯有超越极限的联合攻击才能拯救世界。
501统合战斗航空团迎来了前所未有的危机——直径数十公里的超巨型异形军正缓缓逼近地球。宫藤芳佳作为新晋王牌，必须与来自世界各地的魔女们放下成见，开发出超越个人极限的“联合 Striker Unit”。在一次次失败与牺牲中，她们终于理解了团结的真谛。最终决战中，所有魔女的魔力汇聚成贯穿天地的光之矛，而芳佳为了保护战友，独自冲向了异形军核心。
剧场版在TV版基础上全面升级，空战场面绚丽夺目，角色成长弧光完整。团队协作的主题贯穿始终，高潮部分的情感爆发力极强，是机甲少女题材的巅峰之作。